為全臺罕見設有風水建築的文廟，入口採偏門配置，並設置具有破煞避邪寓意的奇賢門，依傳統「九星寸白法」規制興建，鑲嵌圓形銅鏡並飾以漢白玉螭虎紋，信眾須由兩側繞行進出，展現傳統風水觀念與文廟建築藝術融合的獨特景觀。
萬泉寺主體建築的平面布局，屬於二落二廊帶鐘鼓樓之建築格局。
開山堂是1座主堂帶廂房的建築格局，左廂房已拆除。
登瀛書院的規模小，卻是經過評定為書院類建築物最完整者。
靈泉三塔前的廣大庭園中央，有1條中軸線之磨石子大道，並設置石牌坊1座。
臺灣最美麗的石頭教堂