登瀛书院又名文昌祠，由古色古香的围墙围绕，相当古朴幽静。书院采单进三合院式建筑，正中为三开间正殿，两侧为七间式厢房。过水相连正殿与厢房，有围墙包围建筑物四周，屋顶装饰的剪黏采用相当简洁的形式。建筑格局之所以如此简约，是因为创建时经费短缺，完全为当地仕绅所捐募兴建，与台湾其他书院比较，格局规模也显得较小。
登瀛书院的规模小，却是经过评定为书院类建筑物最完整者。从创建至今一百多年，虽然经历过数次大修，但都能依照原貌加予修缮，不仅正殿的结构体丝毫未更动，连原来的土埆建材也保留未更换成其他材料，加上两排斋舍从没有增减过一间，登瀛书院确实完整的保持初建之原貌，是非常难得而至为珍贵的文化资产。
草屯旧称北投堡，清初时官方设置许多「土番社学」，以教育归顺的原住民子弟。清道光年间（西元1821-1850年）原住民陆续迁往埔里，导致土番社学有名无实，反而汉族人数激增，当时北投堡文风已开，当地仕绅於是筹组读书会「登瀛社」，登瀛书院即是在社员的推动下而成立，是草屯地区第一座学堂。
登瀛书院的规模小，但从创建至今一百多年，虽然经历过数次大修，都能依照原貌加以修缮，不仅正殿的结构体丝毫未更动，连原来的土埆建材也保留未更换成其他材料。
清光绪9年（西元1883年），院舍年久失修，由李定邦（西元1831-1895年）等人倡议予以修建，於隔年竣工。当时学风兴起，人才辈出，前後有十多位文武秀才，地方还有「秀才窝」之雅称。日本时代书院功能消失，以祭祀神只的文昌祠方式取代。登瀛书院正殿主祀文昌帝君，陪祀关圣帝君、孚佑帝君、朱衣神君、魁斗星君等五文昌。
台湾光复後，於民国56年（西元1967年）、民国75年（西元1986年）、民国77年（西元1988年）几次重修而成今貌，并於民国74年（西元1985年）由内政部指定为县定古蹟。民国88年（西元1999年）遭逢921地震，登瀛书院被判定有立即性倒塌危险，於隔年进行抢修工作，并於民国94年（西元2005年）进行彩绘修复工程，重现昔日文风兴盛时之光彩。虽然不再具有书院功能，但是登瀛书院对於文教上的贡献及价值无法抹灭。
位於草屯镇新庄里史馆路文昌巷，创建於清道光27年（西元1847年），至今已有170多年历史。书院中主祀文昌帝君，陪祀关圣帝君、孚佑帝君、朱衣神君、魁斗星君等五文昌，并供奉朱文公、魁斗星君牌位，为三合院式建筑，登瀛书院确实完整的保持初建之原貌，是非常难得且至为珍贵的文化资产。
登瀛书院为单栋正殿带二护龙的格局，外观宏大古朴，书院四周有围墙围绕，正面长13公尺的三脊燕尾照壁。中央为三开门的正殿，并有左右两斋舍（护龙），正殿屋顶剪黏极为简洁，中脊上的龙姿最为吸睛，扬卷的身形跟屋脊燕尾曲线总成的线条极为优美。殿内装饰如木雕以及彩绘，全都以典雅风格为主。中间正殿除了供奉五文昌外，过去也是讲学上课的地方。
拜廊为卷棚架构，门扇开在前柱上，正殿内为三通五爪抬梁式架栋，大通下先有透雕光源，接头处又出一斗拱，拱下再设置一个飞鱼雀替，是传统建筑中少见的做法。在正门上悬挂一块「登瀛书院」匾额，神龛上方则悬挂「文运重兴」、「学教敦伦」等古匾。左右斋舍壁上的书卷状雕饰，也是古意盎然。登瀛书院所保存的文物相当丰富，包括魁星神笔、执事牌、供桌、烛台、竹编子字纸篓、童生篮、魁夫子神位等，都相当完整且是上乘古物，堪称珍贵文化资产。
「春祭大典─点光明灯」是登瀛书院最特别之处，这是为考生祈福之特殊仪式。随着每年考季来临，会有许多考生到书院点上一盏光明灯，祈求文昌帝君可以护佑学子顺利通过考试。「春祭大典─点光明灯」活动，於每年的农历正月三十日举办；在每年文昌帝君的生日农历2月3日，同时举行学士灯及功名灯开灯仪式，该书院管理委员会依古礼准备面线、寿龟等供品举行春祭大典，之後便由穿上祭祀诵经礼服的人员，拿着有登记点上「功名灯」、「学士灯」的名册，一一向文昌帝君报告点灯者姓名，希望神明能保佑考生，可说是登瀛书院最独树一帜之特色。
正殿两侧的雕刻精致，图为鳌鱼雀替，金腹绿背形状奇特。
正殿阶前的御路石雕，形象威仪，大部分孔庙及文昌祠都会看到御路石雕。
中脊上的翘脊剪黏，扬卷的龙姿身形跟屋脊燕尾曲线，汇成优美线条。
神龛上方悬挂多幅古匾，当中「文运重兴」是大正15年（公元1926年）整修时所献；「学教敦伦」则是创建时所悬挂。
魁星神笔是登瀛书院的上乘古物，堪称珍贵的文化资产。