西华堂为三开间的三合院寺庙建筑，进入山门后，由凹寿形的堂门、正殿与两侧厢房组成，朴实样貌与臺湾早期农村三合院无异，中央建筑主体为堂门兼拜殿，大门特别的设计是双扇中门两侧，还各开单扇门作为平时出入之用。正殿结构除四点金柱为石柱，其他都是木柱，前、后殿以山牆衔接，中间八卦月门联通左右厢房，左、右护龙连接偏殿，堂门外还有广大前埕及花园，山门入口右侧有藏经阁。
位于臺南市西华街入口的山门，和一般佛道教庙宇山门风格不同，白牆、红瓦，装饰朴实而不繁複。
西华堂于民国64年(公元1975年)进行最后一次整修，并由臺南春源画室名师潘丽水负责，正殿内所有彩绘，由门神、樑坊、门扇裙堵皆出其手，神龛左右牆堵两幅木刻壁画「迦叶付法」及「师子传法」皆取材自佛教故事。潘丽水对门神的画作不同于一般的平面彩绘，门神两大护法及侧门哼哈二将，特别讲求立体感，并大量使用渐层来表现光影，让人物变得更加逼真写实。
在西华堂左厢房右壁旁立有「西华祖堂碑记」，其他还有3块石碑立于左护龙牆边，上面刻写西华堂修建的略史，这些保留了百年以上的光绪年间石碑，见证斋教在臺湾的历史。
西华堂内老树成群，其中一棵树龄逾2、300年的老梅树，相传为明朝宁靖王朱术桂（公元1617年－1683年）所植，但近年遭细菌感染，由福田树木保育基金会抢救成功重获新生，每至寒冬梅花盛开吸引游客。