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本寺为彰化县三大名岩之最早建造者，具有重要之历史价值，为闽南式合院，正殿屋顶为燕尾脊梁飞龙雕凤，内殿里二通三瓜式，为现存罕见之传统建筑木造结构。

创建於清雍正6年（西元1728年），最早仅由工寮所改建的草庵，在清乾隆10年（西元1745年）时奉祀释迦牟尼及南海观世音菩萨，後因信徒众多香火鼎盛，经募款後建竹寺，之後於清乾隆23年（西元1758年）由泉州僧侣觉通和尚与当地仕绅重新修建寺宇。

清水岩过去曾多次移址，直至清嘉庆年间才建於现址，从清雍正年间以来即为八卦山脉地区主要信仰中心之一，与虎山岩、碧山岩合称中部三大名岩。因地出泉水、风光明媚而同时拥有「清水春光」的美名，更是着名的彰化八景之一，此外清水岩寺里有许多当时文人骚客所留下的题诗，和达官贵人所题匾额，为寺内增添许多文学涵养。

清水岩最初仅是一工寮所改建之草庵，创建於清雍正6年（西元1728年），在清乾隆10年（西元1745年）时经信徒募款建竹寺，初建庙宇时是在武东堡社头庄许厝寮187番地，即是目前所在地的上方山坡地，其位於大武郡山的曲处，在当时是往来南投的「十八弯古道」亦为当时所称的「挑盐古道」上。

清乾隆23年（西元1758年），由泉州僧侣觉通和尚（生卒年不详）与当地仕绅重新修建庙宇，除了供奉释迦牟尼及南海观世音菩萨外，还有阿弥陀佛、药师琉璃光佛两位神只，代表佛法里的「佛、法、僧」三宝佛。清嘉庆4年（西元1799年）迁寺於现址，同时另增建三间瓦栋及二廊，且增加奉祀十八罗汉，此时称为「清水观音亭」。

目前所看到的主体是清光绪5年（西元1879年），由住持邀集乡里仕绅，拆除本体後重修的，经历5年完成修复後，由当时清水岩住持欲标禅师（生卒年不详）敬立「清水春光」匾额，正殿供奉药师琉璃佛、释迦牟尼佛及阿弥陀佛、观世音菩萨与地藏王菩萨，而神龛两侧为供奉清水祖师、注生娘娘。

清水岩虽然经过多次修建，但因岁月侵蚀仍见倾颓，所以在日大正7年（西元1918年）再次整修，这次的整修是增长护龙、增设左右过水门及围塑日月两座天井，於是完成清水岩主要的二殿二廊二护龙三院的格局。清水岩於民国64年（西元1975年）被内政部列入县定古蹟，但因民国73-75年（西元1984-1986年）的改建工程，使原有的清水岩样貌改变，故在民国76年（西元1987年）取消古蹟资格，直到民国92年（西元2003年）再次被彰化县政府指定为县定古蹟。

清水岩与虎山岩、碧山岩同为台湾中部三大名岩，庙体本身不似其他传统大庙，而是面宽仅有三开间，进深只有二落一院的拜庭之传统建筑，但庙体本身正殿屋顶为燕尾脊梁，有飞龙雕凤剪黏，内殿为二通三瓜木栋架形式，均为现存罕见的传统建筑木造结构。

清水岩经过多次改建，其本身的建筑风格也依照各时期有所不同，因此产生了多元混合的样貌，庙宇内空间格局由三川殿与正殿所组成，纵横两条主要轴线，以纵轴线为主轴，为二进一院落的主要空间。正殿与三川殿的土埆墙形成祭祀场所，以中间天井做为采光通风的用途，天井两侧则用檐廊连接正殿与三川殿。民国73年（西元1984年）又以正殿为准，向前延伸，在纵轴线上加建拜亭，做为香客参拜场所；横轴线上，以正殿向两侧延伸，添加护龙，均以过水廊与正殿相通，本身另有独立的进出口，位於左侧为日井（或称龙井），位於右侧则为月井（或称虎井）。而庙门上的「清水岩」字匾则为官赐红底的「清水岩双龙抱珠、火形图记」匾额。

清水岩内有一座「滴水清心」古碑，为日大正9年（西元1920年）所立，记载砌井筑渠引山泉及重修的典故，明订清水岩与龙泉庙共用水源、分配时间，勒石以垂永久，并杜绝纷争。清水岩因本身的自然景观等原因，自清代以来，即是许多文人墨客造访之处，使清水岩具有丰富的人文资源，吸引众多游客前往参拜；又因清水岩在佛、道、民间信仰位阶为「岩仔」，正统的佛教位阶在功能与其他庙宇有分工作用，信众的大力相挺及社区意识之发展，使得清水岩不仅是地方的信仰中心，同样也具有古蹟历史与文化教育之场所。