藍田書院又稱文昌祠，主祀文昌帝君，創建於清道光11年（西元1831年），可稱「南投首學」，其過去的歷史對南投縣之文教發展有相當程度影響。藍田書院和草屯登瀛書院、集集明新書院並列為南投縣三大古蹟書院。藍田寓意「藍田種玉」，以教育後代就像種玉一般，希望能青出於藍，因此定名為「藍田書院」，有化璞玉為美玉之涵意。
藍田書院初創時的配置規模，應為三進二廂式格局，但經過幾次大的變動而遷至現址後，成為現在樣貌的單進二廂式格局，外環以牆圍繞，結構壯麗，屬於三合院式的對稱型態。殿內更擁有精緻的木雕藝術裝飾，以及清代留下來的多幅古匾，具歷史價值。
藍田書院俗稱文昌祠，是南投縣三座書院中最早創建者，源於土番社學後的南投義學。清道光11年（西元1831年），南投縣丞朱懋（西元？-1832年）請南北投（今南投、草屯）及水沙連（今竹山、鹿谷）兩堡的仕紳商議建書院，很快地得到兩堡紳民支持，地點位於街後康壽莊菜園中（俗稱大菜園，即今南投市康壽里藍田街）。書院歷時兩年後竣工，題名為「藍田書院」，並立有「新建南投藍田書院碑記」。「藍田」寓意「藍田種玉」，以教育後代就像種玉一般，希望能青出於藍，因此定名為「藍田書院」，有教化庶民化璞玉為美玉的涵意。
書院主祀文昌帝君，旁為齋舍，兩翼備有廂房。藍田書院建成後，曾於清道光25年（西元1845年）重修，清同治3年（西元1864年）改建於今三民里藍田街，清光緒10年（西元1884年），書院因白蟻之害而重修。
在日本時代，日本人為了順利統治臺灣，於是廢除科舉制度，因而使傳統書院準備科舉考試的功能喪失。日明治29年（西元1896年）南投民軍群起抗日，許多房舍遭日軍毀損，藍田書院的右廡也在此時遭焚毀，經地方仕紳曾長茹（西元1840-1907年）募捐才予以修復。日明治44年（西元1911年）因市區改建進行道路與下水道工程，讓書院出入口受阻，直到日大正4年（西元1915年）遷建至現今文昌街位址。遷建完全「依原貌轉築」，其中差異甚少，尤其大門兩側的木雕格屏，完全是舊材沿用，所以前後建築規模亦相似。
民國46年（西元1957年）書院再次修建，成為現今的樣貌。民國50年（西元1961年）獲准設立鸞堂，並賜號「濟化堂」，意為勉勵濟世勸化，弘揚聖道之所，之後香火日益鼎盛。只是歷經了多次遷建、整修，傳統原貌已失，其書院功能也已式微，僅留祠祀之用。民國74年（西元1985年）經指定為臺閩地區縣定古蹟，之後經歷民國88年（西元1999年）921大地震重創，經修復後如浴火重生的書院，再度成為南投縣之重要文化資產，延續其歷史文化命脈。
藍田書院初創時的配置規模，應為三進二廂式格局，但經過幾次大的變動而遷至現址後，變更為現貌的單進兩廂式格局，屬於三合院式的對稱型態。包括中軸線上的三川門及正殿，外帶兩側廂房，並以過水廊連接，為小規模的書院建築。
正殿為硬山單檐燕尾式的屋頂，屋脊曲度平穩緩和，脊頂並飾有「雙龍搶珠」剪黏，脊腹則有花草剪黏，繁簡適中。在其他裝飾方面，藍田書院因為歷次重修，原有裝飾不斷流失，尤其是正殿的彩繪。但是書院留存的木雕，其手法屬上乘，主要裝飾分布於正殿棟架及神龕，無論是透雕或浮雕，其氣蘊細膩與渾厚兼而有之，是木雕之佳作。
除了建築的特色外，廟內掛著多幅清朝古匾，例如清道光22年（西元1842年）的「天上文衡」，清同治3年（西元1864年）的「文明氣象」，清同治4年（西元1865年）的「奏凱崇文」，清同治7年（西元1868年）的「瑞氣如珠」，以及清同治9年（西元1870年）所立的「丕振斯文」，各有其歷史典故可循，都是廟內珍貴之文物資產。
藍田書院坐西朝東，屬於三合院閩南式建築，新建院門設於東南牆角，名為「奇賢門」，具有避邪及護院功能，是國內文廟中少見的設計。前殿庭前設有照壁一面，照壁有對內祈福、對外辟邪象徵。照壁前方有半月池（古時為泮池）一座，池的兩邊設有旗桿座，是仿古 「華表」之遺風，意寓「中舉」，是文廟的特色之一。廟前豎立碑座，依文獻記載，可以看到先賢創院以來，辛勤耕耘的軌跡。另於左牆邊設置龍池，名為「龍仙水」，與泮池相互對應。
兩側的廂房是傳統式疊桁木構架，及老式土埆所砌築而成。
墨黑底金黃字的「天上文衡」匾，製作於清道光22年（西元1842年）；深紅底金黃字的「文明氣象」匾，製作於清同治3年（西元1864年）。
藍底金黃字的藍田書院銜牌，製作年代為清道光13年（西元1833年），正中為楷書「藍田書院」4個渾厚字體，下方的龍首裝飾也很搶眼。
藍田書院入口處有水泥建造的奇賢門，此門具有破煞避邪的功能，為一般書院或廟宇少見之建築。
這幅交趾陶裝飾畫的是孫真人（唐朝名醫孫思邈）畫點龍睛的故事。
書院的門很多都是藍底配上紅色的畫像或對聯，相當醒目。
新建院門「奇賢門」設於東南方牆角，是一般書院少見的建築方式。