; 水仙宮內保存多幅民國37年(公元1948年)整修時的泥塑加彩繪作品，其中位於正殿後面的「富貴圖考」是描述唐代名將郭子儀（公元698年或697年-781年）老年富貴生活，而大殿旁還有「忠心孝恩」、「神槍暗傳」、「轅門斬子」及另一斑剝不可考的作品。這些泥塑加彩繪數十年來經「鹽化」而產生剝落，反而增生古色古香的味道。泥塑由名師江清露（公元1914年-1994年）完成，之後再由彩繪名師陳玉峰（公元1900年-1964年）上色，這種組合全臺僅見。而前過水廊左右還有四面美人圖，包括拾玉環、貂蟬嘆月、貴妃醉酒、送京娘，雖有剝落依然風姿卓絕。
後殿兩側山牆上已歷160餘年的「南極壘輝月」、「瑤姬獻壽」泥塑圖，精細美觀，足見早期作工繪畫之精細。
新港水仙宮門神彩繪施作於三川門明間和左右次間共6扇門上，是彩繪大師陳玉峰全臺遺作中保存最為完整的廟門，門神畫面飽滿有生氣、威武中不帶嚴肅，民國98年(公元2009年)還特聘德國壁畫修復大師以復原式古蹟修復法進行修復，是國內首度以國際博物館級方式修復傳統廟門。
位於正殿前一對蟠龍石柱造型古樸、線條簡潔卻不失渾厚之感，上面落款時間為清乾隆45年(公元1780年)，由笨港貢生林開周(生卒年不詳)所捐贈，成為水仙宮建廟落成的重要證物。
水仙宮側面山牆從三川門、前過水廊、拜殿、正殿、後過水廊到後殿，燕尾脊脊尾飛揚、曲線優美、層層相連，形成一道美麗白色山牆。和下方的鳥踏(山牆外面凸出的水平線條)，構成極佳視覺效果。